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配列比較ソフトウェアMTerm | ||
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「MTerm」は空間符号化技術とモアレ現象を利用し,二つのゲノム配列間の関係をモアレ縞により視覚化するソフトウェアであり,その原理は空間符号モアレマッチング技術(SCMM;Spatially Coded Moire Matching Technique)に基づきます. 「MTerm」では,2配列の符号化画像の作成及び重ね合わせを1画面上に表示させることにより,既存のPCを簡易モアレ情報端末として利用することができます. 「MTerm」は,配列一致部位,ギャップ,一塩基置換などを出現するモアレ縞の位置やずれなどで抽出することができます.また,塩基配列のみらなず,アミノ酸配列にも適用できます. 図に,MTermによる配列比較結果の例を示します.
MTermでは,画面上のモアレ縞を操作したり,様々な符号化ルールを適用させることで以下の機能を実現します. ○出力モアレ縞操作による機能
○符号化法操作による
○1画面上において
現在β版を作成し,改良を進めています.利用を希望される場合は,下記まで連絡をお願いいたします. mail to:ogura[at]ist.osaka-u.ac.jp |